Šifra predmeta:
457B1		 Naziv predmeta:
Proteinski inženjering

Školska godina:

2019/2020.

Uslovi pohađanja:

Nema uslova

ESPB:

4

Vrsta studija:

master akademske studije

Studijski program:

Biohemija: 1. godina, zimski semestar, izborni (E51B1), stručno-aplikativni predmet

Nastavnik:

dr Radivoje M. Prodanović
redovni profesor, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd

Saradnik:

dr Ana Marija J. Balaž
istraživač-pripravnik, Institut za hemiju, tehnologiju i metalurgiju, Njegoševa 12, Beograd

Fond časova:

Nedeljno: dva časa predavanja + dva časa laboratorijskih vežbi (2+0+2)

Ciljevi:

Cilj kursa je upoznavanje studenata sa savremenim metodama dizajna i inžinjeringa proteinske strukture i funkcije.

Ishod:

Ovladavanje teorijskim i eksperimentalnim metodama za dizajn i inžinjering proteinskih molekula.

Oblici nastave:

Predavanja, seminarski radovi, laboratorijske vežbe.

Vannastavne aktivnosti:

—

Literatura:
  • Sheldon J. Park, Jennifer R. Cochran: Protein Engineering and Design, CRC Press 2010.
  • S. Brakmann, K. Johnsson: Directed Molecular Evolution of Proteins, WILEY-VCH 2002.
  • Odabrani revijalni radovi

Dodatni materijal:

—

  Nastavne obaveze i način ocenjivanja

Predavanja:

10 poena (2 časa nedeljno)

Program rada:

  1. Teorije evolucije proteina i in silico dizajn proteina.
  2. In vitro evolucija proteina - principi i problemi.
  3. Ekspresija proteina na površini faga, ribozoma i ćelija u proteinskom inžinjeringu.
  4. Ekspresija proteina in vitro translacionim sistemima u proteinskom inžinjeringu.
  5. Kreiranje biblioteka gena - duplikacija gena, cirkularna permutacija, fuzija gena, kombinovanje egzona, tačkaste mutacije, rekombinacija.
  6. Stabilizacija strukture proteina kombinatornom konsenzus mutagenezom.
  7. Dizajn metoda pretraživanja biblioteka gena - principi i problemi.
  8. Bioinformatičke metode analize povezanosti proteinske sekvence i funkcije u proteinskom inžinjeringu - PROSAR.

Laboratorijske vežbe:

20 poena (2 časa nedeljno)

Program rada:

  1. Generisanje biblioteke gena saturacionom mutagenezom, rekombinacijom i error prone PCR-om.
  2. Transformacija kvasca S. cerevisie i ekspresija proteina na površini ćelija.
  3. Ekspresija i pretraživanje biblioteke gena u mikrotitar pločama.
  4. Ekspresija i pretraživanje biblioteke gena korišćenjem in vitro kompartmentalizacije i protočne citometrije.

Seminarski radovi:

20 poena

Usmeni ispit:

50 poena