Školska godina: |
2019/2020. |
Uslovi pohađanja: |
Nema uslova |
ESPB: |
4 |
Vrsta studija: |
master akademske studije |
Studijski program: |
Biohemija: 1. godina, zimski semestar, izborni (E51B1), stručno-aplikativni predmet |
Nastavnik: |
dr Ljubodrag V. Vujisić
vanredni profesor, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd |
Saradnik: |
dr Gordana B. Krstić
docent, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd |
Fond časova: |
Nedeljno: dva časa predavanja + dva časa laboratorijskih vežbi (2+0+2) |
Ciljevi: |
Obuhvaćene su sledeće oblasti instrumentalnih metoda koje su od značaja za biohemiju:
- Višepulsne 1D, 2D, 3D i 4D NMR metode - merenje spektara, primena.
- Biopolimeri - Određivanje primarne, sekundarne i tercijarne strukture proteina pomoću 2D, 3D i 4D NMR metoda.
- 15N i 31P NMR spektroskopija - primena u biohemiji.
- Različiti tipovi maseno-spektrometrijskih jonskih izvora i analizatora.
- Tandemna (MS/MS) i višestepena spektrometrija masa (MSn) - merenje spektara, primena.
- Kombinacije tečne hromatografije sa masenom spektrometrijom i NMR spektroskopijom (LC/MS, LC/MS/MS, LC/MSn, LC/NMR).
- Određivanje strukture proteina maseno-spektrometrijskim metodama.
|
Ishod: |
Nakon završetka kursa studenti će biti obučeni za rešavanje struktura organskih jedinjenja primenom višepulsnih NMR eksperimenata i modernih metoda masene spektrometrije. |
Oblici nastave: |
Predavanja, eksperimentalne i teorijske vežbe. |
Vannastavne aktivnosti: |
— |
Literatura: |
- Slobodan Milosavljević: Strukturne instrumentalne metode
- Dejan Gođevac i Vele Tešević: Strukturne instrumentalne metode - zbirka spektara
- Clerck Pretsch and Simon Seibl: Tablice za određivanje strukture organskih jedinjenja
|
Dodatni materijal: |
— |
Nastavne obaveze i način ocenjivanja |
Predavanja: |
0 poena (2 časa nedeljno)
Program rada:
1. NMR spektroskopija
- (i) Novije višepulsne 1D NMR metode (INEPT, APT, DEPT, NOE, merenje T1 i T2)
- (ii) Dvodimenzionalne (2D) NMR metode (2DJ razložen NMR, COSY, TOCSY,HSQC, HMBC, NOESY, DOSY) i njihova primena za analizu biomolekula
- (iii) Trodimenzionalne (3D) i četvorodimenzionalne (4D) NMR metode (HNCA, HNCO, HN(CA)CO, HN(CO)CA, HNCACB, CBCA(CO)NH, HCCH-TOCSY, 15N-TOCSY-HMQC, 15N-NOESY-HSQC) i njihova primena za određivanje strukture biopolimera - proteina
- (iv) Detekcija 15N i 31P NMR spektara i njhova primena u biohemiji
- (v) Kombinacije tečne hromatografije sa NMR spektroskopijom (LC/NMR)
2. Masena spektrometrija
- (i) Jonski izvori (EI, CI, FD, FAB, SIMS, PD, MALDI, SELDI, ESI, APCI, APPI, CID/CAD)
- (ii) Razdvajanje jona - Analizatori (B, E, Q, jonska klopka (IT), TOF, ICR, Orbitrap)
- (iii) Tandemna spektrometrija masa (MS/MS ili MS2) i višestepena spektrometrija masa (MS/MS/MS....., MSn)
- (iv) Kombinacije tečne hromatografije sa masenom spektrometrijom (LC/MS, LC/MS/MS, LC/MSn)
- (v) Određivanje strukture proteina MS/MS metodama
|
Laboratorijske vežbe: |
10 poena (2 časa nedeljno)
Program rada:
- Određivanje strukture organskih jedinjenja na osnovu H,H - COSY spektara uz primenu empirijskih tablica.
- Određivanje strukture organskih jedinjenja na osnovu HETCOR spektara uz primenu empirijskih tablica.
- Određivanje strukture organskih jedinjenja na osnovu DEPT spektara uz primenu empirijskih tablica.
- Određivanje strukture organskih jedinjenja na osnovu 2DJ spektara uz primenu empirijskih tablica.
- Određivanje strukture organskih jedinjenja na osnovu H,H - NOESY spektara uz primenu empirijskih tablica.
- Upoznavanje studenata sa postojećom opremom Hemijskog fakulteta (GC, LC, MS, GC/MS, LC/MS); priprema uzoraka, snimanje spektara i njihova interpretacija.
|
Kolokvijumi: |
30 poena |
Pismeni ispit: |
30 poena |
Usmeni ispit: |
30 poena |