ISTRAŽIVAČKA GRUPA ZA PROTEOMIKU
prof. Tanja Ćirković Veličković

Saradnici

1. Tanja Ćirković Veličković, redovni profesor biohemije Univerziteta u Beogradu, redovni profesor hemije hrane Univerziteta u Gentu, dopisni član SANU
2. Dragana Stanić Vučinić, naučni savetnik
3. Katarina Smiljanić, viši naučni saradnik
4. Vesna Jovanović, viši naučni saradnik
5. Jelena Radosavljević, docent
6. Marija Stojadinović, docent
7. Jelena Aćimović, naučni saradnik
8. Marija Peruško, naučni saradnik, Inovacioni centar Hemijskog fakulteta
9. Maja Krstić Ristivojević, istraživač-saradnik
10. Tafadžva Kaseke, istraživač-saradnik
11. Mirjana Radomirović, istraživač-pripravnik
12. Ana Simović, istraživač-pripravnik
13. Maja Mladenović, istraživač-pripravnik
14. Tamara Vasović, istraživač-pripravnik
15. Tamara Lujić, istraživač-pripravnik

Oblast istraživanja

Metodama "shotgun" proteomike i imunoproteomike se otkrivaju antigeni važni za razvoj imunodijagnostičkih testova i dizajn vakcina za lečenje infekcija različitim patogenima, ali i za ispitivanje posttranslacionih modifikacija proteina i bolje razumevanje biologije ovih organizama i infekcija koje izazivaju.

Modifikacije proteina izazvane obradom hrane i pod uticajem zagadjivača poreklom iz životne sredine mogu da utiču na procese digestije i preuzimanje proteina hrane u gastrointestinalnom sistemu, kao i na procese koje ovi proteini indukuju u ćelijama imunog sistema.

Posebno se razvijaju analitičke metode i ispituju interakcije novih zagađivača poreklom iz životne sredine (mikro i nanoplastike) sa proteinima, enzimima i receptorima na ćelijama imunog sistema i epitelijalnim ćelijama.

Oprema koju grupa koristi u radu

1. Ultracentrifuga Sorwall 80 model WX sa odgovarajućim priborom, proizvođač ThermoFisher Scientific, SAD
2. Visokoefikasni tečni hromatografi ÄKTA purifier 10 HPLC, proizvođača GE Healthcare, SAD
3. Visokoefikasni tečni hromatograf Waters Breeze1525 i ECD2465 HPLC sa elektrohemijskom detekcijom, proizvođača Waters, SAD
4. Zamrzivač sa dubokim zamrzavanjem na -70°C firme TENAK, Danska
5. Zamrzivač sa dubokim zamrzavanjem na -80°C firme Thermo Electron Corp., SAD
6. Laserski protočni citometar FACS Calibur firme BD Biosciences, SAD
7. Sistem za ultračistu vodu Smart2Pure model 3 UV/UF firme ThermoFisher Scientific, SAD
8. Spektrofotometar NanoDrop 2000C, proizvođač Thermo Scientific, SAD
9. Oprema za elektroforetsko razdvajanje proteina firme Hoefer Inc., SAD, model SE660
10. Mini Protean BioRad elektroforetski sistem
11. Aparat za izoelektrično fokusiranje Ettan IPGPhor3 firme GE Healthcare, SAD
12. Komora Captair FlowCap 700 proizbođača Erlab, SAD
13. Laserski skener gelova i membrana Typhoon FLA7000 firme GE Healthcare, SAD
14. PCR uređaj Mastercycler firme Eppendorf, Nemačka
15. ES20 termošejker sa inkubatorom firme Biosan Laboratories
16. Termošejker Unimax 1010 sa inkubatorom Unimax 1000 firme Heidolph, Nemačka
17. Koncentrator firme Eppendorf, Nemačka, model 5301
18. Laminar Ehret BIO-CL-130 firme EHRET GmbH, Nemačka
19. Laminar Hera Safe firme Thermo Scientific, SAD
20. Rotor-Gene Q, RT-PCR firme Qiagen, Nemačka
21. CO₂ inkubator Thermo Scientific Water Jacket, firme Thermo Scientific, SAD, model Series II
22. CO₂ inkubator HERA Cell 150, firme Thermo Scientific, SAD
23. Centrifuga Eppendorf 5804R, firme Eppendorf, Nemačka
24. Hibridni maseni spektrometar LTQ Orbitrap XL sa Acella UHPLC i easyLC II nanoLC sistemima firme ThermoFisher Scientific, SAD
25. CD spektrometar JASCO J-815 firme JASCO, Japan
26. Spektrofluorimetar FluoroMax-4 firme Horiba, Japan
27. Bioreaktor BIOSTAT B plus 2L DW 230V firme Sartorius Stedim Systems GmbH, Nemačka
28. Centrifuga Hettich R460 firme Hettich, Nemačka
29. Inkubator i šejker New Brunswick Innova 42/42R firme Eppendorf, Nemačka
    (serijski broj SI42FJ002780); oprema nabavljena preko JUP-a 2017. god; laboratorija 434
30. Analitička vaga AS 82/220.R2 firme Radwag, Poljska
31. Inkubator šejker New Brunswick Innova 42, Eppendorf
32. Uređaj za merenje transepitelnog otpora (TEER), Milicell ERS-2 Voltohmmeter, Millipore

Publikacije

1. T. Cirkovic Velickovic*, D. Stanic-Vucicnic, The Role of Dietary Phenolic Compounds in Protein Digestion and Processing Technologies to Improve their Antinutritive Properties, Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety, 2018, 17(1): 82-103
   (Food Science and Technology 5/130, IF₂₀₁₆ = 5,974), M21a, DOI: 10.1111/1541-4337.12320
2. Ajasja Ljubetič, Fabio Lapenta, Helena Gradišar, Igor Drobnak, Jana Aupič, Žiga Strmšek, Duško Lainšček, Iva Hafner-Bratkovič, Andreja Majerle, Nuša Krivec, Mojca Benčina, Tomaž Pisanski, Tanja Ćirković Veličković, Adam Round, José María Carazo, Roberto Melero, Roman Jerala, Design of coiled-coil protein-origami cages that self-assemble in vitro and in vivo, Nature Biotechnology, 2017, 35:1094–1101
   (Biotechnology and Applied Microbiology 2/161, IF₂₀₁₅ = 43.113), M21a, DOI: 10.1038/nbt.3994
3. Moons J., de Azambuja F., Mihailovic J., Kozma K., Smiljanic K., Amiri M., Cirkovic Velickovic T., Nyman M., Parac-Vogt T.N., Discrete Hf18 Metal-oxo Cluster as a Heterogeneous Nanozyme for Site-Specific Proteolysis, Angewandte Chemie - International Edition, 2020, 59(23): 9094-9101
   (Chemistry, Multidisciplinary 15/177, IF₂₀₁₉=12.959), M21a, DOI: 10.1002/anie.202001036
4. Smiljanic K., Prodic I., Apostolovic D., Cvetkovic A., Veljovic D., Mutic J., van Hage M., Burazer L., Cirkovic Velickovic T., In-depth quantitative profiling of post-translational modifications of Timothy grass pollen allergome in relation to environmental oxidative stress, Environment International, 2019, 126:644-658
   (Environmental Sciences 8/251, IF₂₀₁₈= 7.943), M21a, DOI: 10.1016/j.envint.2019.03.001
5. Radibratovic M., Al-Hanish A., Minic S., Radomirovic M., Milcic M., Stanic-Vucinic D., Cirkovic Velickovic T., Stabilization of apo α-lactalbumin by binding of epigallocatechin-3-gallate: Experimental and molecular dynamics study, Food Chemistry, 2019, 278:388-395
   (Food Science and Technology 7/135, IF₂₀₁₈ = 5.399), M21a, DOI: 10.1016/j.foodchem.2018.11.038, ISSN: 0308-8146

Partneri

1. Institut zavirusologiju, vakcine i serume "Torlak", Beograd
2. Institut za primenu nuklearne energije INEP, Beograd
3. Karolinska institut, Štokhlom, Švedska
4. Univerzitetska dečja klinika Tiršova, Beograd
5. Zdravstveni naučni centar Univerziteta Šenžen, Šenžen, Kina
6. Institut za nauke o proceni rizika, Veterinarski fakultet, Utreht, Holandija
7. Bečki Medicinski univerzitet, Beč, Austrija
8. Univerzitet u Beču, Beč, Austrija
9. Institut za biologiju Karelijskog istraživačkog centra Ruske akademije nauka, Karelija, Rusija
10. Gent univerzitet, Gent, Belgija
11. KU Luven, Luven, Belgija

Projekti

Međunarodni projekti:

1. 2021-2025: "An Innovative Analytical Platform to Investigate the Effect and Toxicity of Micro and Nano Plastics Combined with Environmental Contaminants On the Risk of Allergic Disease in Preclinical and Clinical Studies - IMPTOX", finansijer: EU Comission, Research Executive Agency (REA) European Commission - H2020, rukovodilac: prof. dr Tanja Ćirković Veličković
2. 2018-2021: "Twinning of research activities for the frontier research in the fields of food, nutrition and environmental ‘omics - FoodEnTwin", finansijer: European Comission, Research Executive Agency (REA) European Science Fund - H2020, rukovodilac: prof. dr Tanja Ćirković Veličković
3. 2020-2021: "Sustainable production of serological IgG test for SARS CoV-2", finansiran od strane UNDP/WHO, rukovodilac: prof. Tanja Ćirković Veličković
4. COST akcija CA18227: "The Core Outcome Measures for Food Allergy" ("Osnovne mere ishoda za alergije na hranu"), član Upravnog Odbora dr Tanja Ćirković Veličković, redovni profesor i dopisni član SANU; zamenik člana upravnog odbora dr Jelena Radosavljević, docent.

Nacionalni projekti:

1. "Development of the assays for detection of SARS Cov-2 virus capsid proteins in biological fluids of COVID19 patients - CAPSIDO", finansiran od strane Fonda za nauku Republike Srbije u okviru Specijalnog programa istraživanja COVID19, rukovodilac: prof. Tanja Ćirković Veličković
2. 2020-2021: PoC-5894 "Proizvodnja proteina, potencijalnog markera alergije na lipu", finansijer: Fond za inovacionu delatnost Republike Srbije, rukovodilac: Jelena Radosavljević
3. 2020-2022: "Late Embryogenesis Abundant Proteins: Structural Characterization and Interaction with α-Synuclein - LEAPSyn-SCI", finansijer: Fond za nauku RS, učesnik na projektu: Jelena Radosavljević
4. "Metagenome Mining of Enzymatic Activity for Synthetic Applications" - rukovodilac: doc. dr Jelena Radosavljević (Srbija-Ujedinjeno Kraljevstvo)
5. "Development of ELISA and immuno-PCR for sensitive and specific detection of shellfish tropomyosin" - rukovodilac: prof. dr Tanja Ćirković Veličković (Srbija-Belgija)
6. "Efekti zagađenja životne sredine na ekspresiju i modifikacije proteina poreklom iz hrane", broj F-26, finansiran od strane SANU, rukovodilac: prof. Tanja Ćirković Veličković