Шифра предмета:
281A2
Назив предмета:
Метаболомика

Школска година:

2023/2024.

Услови похађања:

Нема услова.

ЕСПБ:

10

Врста студија:

докторске академске студије

Студијски програми:

Хемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E71H2), стручно-апликативни предмет

Хемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E72H2), стручно-апликативни предмет

Хемија: 2. година, зимски семестар, изборни (E74H2), стручно-апликативни предмет

Хемија: 2. година, зимски семестар, изборни (E73H2), стручно-апликативни предмет

Биохемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E71B2), стручно-апликативни предмет

Биохемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E72B2), стручно-апликативни предмет

Биохемија: 2. година, зимски семестар, изборни (E74B2), стручно-апликативни предмет

Биохемија: 2. година, зимски семестар, изборни (E73B2), стручно-апликативни предмет

Наставници:

др Дејан М. Гођевац
научни саветник, Институт за хемију, технологију и металургију, Његошева 12, Београд

др Љубодраг В. Вујисић
ванредни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадници:

Фонд часова:

Недељно: пет часова предавања + три часа студијског истраживачког рада

Циљеви:

Циљ овог предмета је да упозна студенте са дефиницијом и основним принципима метаболомике. Желимо да студенти савладају премисе при поставци експеримента, узорковања и припреме узорака за различите аналитичке платформе. Студенти ће бити упознати са основама мултиваријантне анализе података, у циљу интерпретације добијених резултата.

Исход:

Након завршетка курса студенти ће бити оспособљени да:

  • разумеју циљ метаболомике као мултидисциплинарне науке;
  • разумеју концепт аналитичких платформи (хроматографија, масена спектрометрија и NMR) које се користе за метаболомику;
  • разумеју мултиваријантне анализе података у метаболомици.

Облици наставе:

Предавања, домаћи радови, семинарски радови, колоквијуми.

Ваннаставне активности:

Предавања гостујућих предавача.

Литература:

  1. Silas G. Villas-Boas, Ute Roessner, Michael A. E. Hansen, Jorn Smedsgaard, Jens Nielsen: Metabolome analysis - an introduction, John Wiley & Sons, Inc.
  2. Multi- and Megavariate Data Analysis, Part I: Basic Principles and Applications, Umetrics AB

Додатни материјал:

  Наставне обавезе и начин оцењивања

Предавања:

0 поена (5 часова недељно)

Програм рада:

  1. Метаболомика као мултидисциплинарна наука.
  2. Место метаболомике у системској биологији - холистички приступ у научним истраживањима.
  3. Примарни и секундарни метаболити - разноликост структура и физичко-хемијских особина.
  4. Узорковање - "квенчовање" ћелијског метаболизма.
  5. Технике одвајања малих молекула од макромолекула.
  6. Одабир аналитичке платформе.
  7. Припрема узорака за GC-MS анализу - технике дериватизације и ињектовања.
  8. Припрема узорака за LC-MS анализу - екстракција на чврстој фази.
  9. Одређивање структуре метаболита на основу GC-MS и LC-MS података.
  10. Одређивање структуре метаболита у смеши техникама NMR спектроскопије.
  11. Препроцесирање података за мултиваријантну анализу.
  12. Основне методе мултиваријантне анализе података у метаболомици - PCA, OPLS, OPLS-DA.
  13. Примена метаболомике у медицинској дијагностици.

Семинарски радови:

40 поена

Колоквијуми:

10 поена

Усмени испит:

50 поена

Студијски истраживачки рад:

0 поена (3 часа недељно)